科技部部长万钢在两会期间表示：“汽车的发展问题除了要考虑经济效益外，最重要的问题是所有的汽车制造商都有义务减少排放、节约能源。”万钢此前在南开大学就职期间，就一直是新能源汽车的积极推进者之一，而且他还主导研发了我国自行研发的新能源汽车，这次机构改革后，相关文件也明文规定“国家重大汽车高新技术的研究与开发管理职能由科技部行使”；但与此同时，汽车尾气污染和噪声污染防治等皆由升格后的环境保护部监管，而关于新能源行业产业政策制定标准还将由后续的能源部负责管理，如此一来，关于汽车新能源治理不可避免出现多部门参与管理的现实状况。 
      在此前的两会期间，一位不愿具名的汽车企业代表说：“目前的情况是，有些事很多人都想管；有些事谁都不管。大部制就是要解决这个问题，使分工更明确，有专门的部门负责，有统一的部门进行协调。”但从这次改革后的现实状况看，显然没有如这位代表所愿。
      就在大部制改革方案的指向中，明显有这样的表述：“加强能源治理机构”、“合理配置宏观调控部门职能”。从改革构想看，国家能源局级别确定为副部级，国务委员兼国务院秘书长华建敏对方案所作的说明为，国家能源局主要负责拟订并组织实施能源行业规划、产业政策和标准，发展新能源，促进能源节约等。
      国家能源领导小组办公室能源法起草专家组常驻专家吴钟瑚表示，能源局作为“国家局”，其独立性大大增强，“做事情肯定比部委局要好得多”。“很明显，呼之欲出的能源部将在未来汽车新能源的应用和管理上拥有更强的发言权，而能源部出炉前后，如何与原先的几大管理方协调，将是未来生产企业关注的重点。”一位汽车企业代表在接受采访时表示。